เดิมสมาคมประสาททางเดินอาหารและการเคลื่อนไหว (ไทย) ได้เริ่มก่อตั้งเป็นชมรม ในปี พ.ศ. 2538 ชื่อว่า “ชมรมโมธิลิตี้แห่งประเทศไทย” โดย ศ.นพ.พินิจ กุลละวณิชย์ ซึ่งเป็นนายกสมาคมทางเดินอาหารแห่งประเทศไทยในขณะนั้น เสนอให้ ศ.นพ.สิน อนุราษฎร์ เป็นประธานชมรม ในระยะต่อมาได้มีแพทย์ผู้เชี่ยวชาญหลายๆท่านเข้ามาร่วมและสนใจด้าน GI Motility เพิ่มขึ้นเรื่อยๆ ทำให้ชมรมโตขึ้นและได้จัดตั้งเป็นสมาคมในปี พ.ศ. 2552
